Kyoto, en l'an 1863 le gouvernement du shogun Tokugawa , en place depuis 200 ans vit ses derniers soubresauts. Parmis tous les mouvements dont le but est de prendre le pouvoir il en est un dont le but est d'apporter au Japon une nouvelle ère de paix. Parmis ses assassins il en est un surnommé Hitokiri Batosai (l'assassin à l'épée divine).
Cet animé retrace l'histoire d'un assasin Japonais(kenshin)qui voulant apporter la paix dans le Japon se retrouve dans une guerre civile sanglante. On assiste petit à petit à l'évolution de Kenshin qui perd de plus en plus de sa froideur d'assassin.
Une série suit cet OAV, dans cette série (voir la fiche correspondante) Kenshin, conformément à ce que l'on voit à la fin du dernier OAV refuse de tuer et l'ambiance n'est plus du tout à la noirceur (loin de là même ;) ).
